Происходил из рода московских дворян Савеловых. Дворянское происхождение заставило его в молодости поступить на военную службу, но эта деятельность была не по душе молодому Савелову, и на 35 году жизни (в 1655 году) он оставил воинское звание и вступил в число иноков Киево-Межигорского монастыря.

В 1657 году назначен патриархом Никоном строителем Новгородского Иверского монастыря. Вскоре, по ходатайству боярина Ртищева, переведен в Москву строителем Андреевского монастыря, а затем келарем Новоспасского монастыря.

22 декабря 1672 года хиротонисан во епископа Новгородского с возведением в сан митрополита.

26 июля 1674 года, после годового междупатриаршества, избрат Патриархом Московским.

В 1681 году дал грамоту о построении каменной церкви в честь Владимирской Божией Матери в г. Арзамасе, вместо сгоревшей.

В 1685 году посвящал Гедеона, князя Четвертинского, в митрополита Киевского.

Скончался 17 марта 1690 года. Погребен в Московском Успенском соборе.

Самостоятельная деятельность Иоакима проявилась с 1673 года, с назначением его митрополитом Новгородским.

Первые его распоряжения касались внешней обрядности, на которую он вообще обращал большое внимание.

Он указал игуменам и протопопам, спорившим о местах, "кому под кем стоять и заседать", установил кем должна собираться церковная дань, ввел представление сведений митрополиту о материальном положении притча и приходов.

В 1673 году посылал из Новгорода архимандрита Макария на увещевание взбунтовавшихся монахов Соловецкого монастыря.

Будучи избран на патриарший престол, Иоаким за все свои 16 лет патриаршества принимал деятельное участие в событиях религиозной и политической жизни Московского государства.

Основные его усилия были направлены на борьбу против новых веяний, проникавших в то время в русское общество, против стремлений сблизиться с иноземцами, против иностранного влияния, шедшего главным образом из Польши.

Представителями польско-латинской культуры в Москве были выходцы из южной России, особенно после присоединения Малороссии к Московскому государству. В Москве в тот период образовались две религиозно-политические партии - одна латинствующая, во главе которой стоял ученый монах, настоятель Заиконоспасского монастыря, Сильвестр Медведев, другая - ревнителей православия, возглавляемая патриархом Иоакимом.

Для борьбы с польско-латинским направлением патриарх Иоаким испросил в 1685 году от восточных патриархов двух ученых греков, монахов братьев Лихудов поставил их во главе "греческого" училища, основанного в Москве в 1679 году, и поручил им опровергать сочинения латинствующих. Но этим борьба не закончилась. По инициативе патриарха Иоакима созывался собор, на котором Медведев был приговорен к строгому заключению. В дальнейшем передан гражданским властям, подвержен пыткам и казнен.

С чувством особой суровости и даже враждебности относился патриарх Иоаким к расколу. Строгость и суровость проявлял он и в отношении ко всей пастве.

С особой настойчивостью преследовал Иоаким патриарха Никона, низложенного с патриаршего престола. В 1676 году он перевел последнего в Кириллов монастырь под строжайший надзор.

Следует отметить, что патриарх Иоаким проявлял большую заботу о духовенстве. Он стремился поставить его в юридическую и материальную независимость от светской власти, выделить среди других сословий и доставить ему, по возможности, самостоятельность во внутреннем его управлении.

Оценивая деятельность патриарха Иоакима, можно сказать, что он не является личностью светлой и симпатичной; даже среди современников он выделялся своей нетерпимостью и суровым, подчас жестоким фанатизмом. В тоже время он представляет из себя личность цельную, с твердым и непреклонным характером, с непоколебимой силой воли, с железной энергией и настойчивостью.