Как-то Златоуст получил от одного малоазийского епископа жалобу, что в Церкви Ефесской процветает симония — торговля церковными должностями и рукоположение за деньги. Святитель Иоанн потребовал от подателя жалобы надежных свидетелей и доказательств, и дело было временно отложено.
С древних времен Церковь придерживалась правила, что каждая Поместная Церковь имеет самостоятельность и епископ другой Церкви вторгаться в их дела не может.
Между тем ситуация с Ефесской Церковью обострялась и требовала скорейшего уврачевания — умер митрополит Ефесский, оставив свою Церковь в крайне бедственном положении. После слезной мольбы ефесского клира помочь их Церкви святитель Иоанн отправился в Ефес. Там Собор под его председательством низложил тринадцать епископов, виновных в симонии, и поставил нового главу Ефесской Церкви.